Гербарий электронный: Депозитарий живых систем

Цифровой гербарий: в ЦСБС СО РАН сканируют растения, засушенные 200 лет назад

​В коллекции гербария Центрального сибирского ботсада — почти миллион образцов сосудистых растений, мхов, лишайников, грибов и водорослей. Полистать альбомы может любой посетитель. Но чаще с образцами работают учёные. Причём не только новосибирские, но и зарубежные. 

Для удобства бумажную коллекцию переводят в электронный формат — оцифровывают на особом сканере. Он не портит растения и делает качественные снимки. Их исследователи могут найти на сайте ботсада. 

«На основе гербария проводятся исследования биоразнообразия, поскольку гербарный образец — это единственное доказательство того, что в данном месте в данное время росло конкретное растение. Поэтому все гербарные коллекции являются национальным и мировым достоянием», — объяснила руководитель исследовательской группы уникальной научной установки «Гербарий высших растений, лишайников и грибов» Центрального сибирского ботанического сада СО РАН Наталия Ковтонюк. 

Пока оцифровали лишь несколько процентов гербария. Особенно важно отсканировать самые старые образцы. В коллекции ботсада есть растения, которые засушили почти 200 лет назад. Пополняют гербарий и сегодня. 

«Выбирается экземпляр по возможности с цветками, с плодами или хотя бы либо цветки, либо плоды, выкапывается с корнем по возможности. Большая часть гербария монтируется под А3, то есть всё, что не вмещается в этот объём, как-то обрезается», — рассказала сотрудница исследовательской группы уникальной научной установки «Гербарий высших растений, лишайников и грибов» Центрального сибирского ботанического сада СО РАН Ирина Хан. 

Сушат и прессуют растения сразу же — складывают между газетами. В жаркую погоду гербарий будет готов через три дня, в дождливую — приходится ждать неделю и чаще менять газеты, чтобы растение не отсырело. Затем его добавляют в альбом. 

«Вот это уже высушенное растение кладётся на определённый картонный лист, пришивается, где-то приклеивается — и затем делается этикетка. На этой этикетке указываются латинское название растения, местность, откуда оно собрано, кем собрано — сборщик — и дата», — перечислила технический куратор гербария имени М. Г. Попова Центрального сибирского ботанического сада СО РАН

Ирина Деюн. ​

Папки с гербарием лежат в особых шкафах в тёмном помещении. При правильных условиях, говорят учёные, в таком виде растения могут храниться очень долго. 

Анна Братушкина 

Фото: csbg-nsk.ru 

Ботанические коллекции ИБПС ДВО РАН (основные сведения)

Ботанические коллекции ИБПС ДВО РАН (основные сведения)

Гербарий ИБПС ДВО РАН основан в 1970 г., состоит из коллекций сосудистых растений, грибов, лишайников и мохообразных. Международный индекс гербария – MAG (присвоен в 1997 г.).

Гербарий сосудистых растений включает сборы сотрудников института с 1970 г., а также образцы более ранних лет (1940-1960 гг.), переданные из землеустроительной экспедиции, постоянно пополняется новыми сборами. В гербарии представлены образцы более 1700 видов сосудистых растений. Общее количество листов превышает 110000. Большая часть коллекции представлена сборами из Магаданской области и сопредельных территорий – Приморья, Камчатки, Чукотки, Командорских о-вов и др. Сосудистые растения расположены по системе Энглера, родам присвоены номера по Dalla Torre, внутри родов – по алфавиту. Выдержан также географический принцип расположения. Электронный каталог гербарных этикеток существует для отдельных семейств и родов. С 2006 г. в каталог заносятся все новые сборы растений.

С 2020 г. формируется Цифровой гербарий MAG на платформе Цифрового гербария МГУ и в GBIF.

В 2015 г. была проведена работа по выявлению типовых образцов в основном фонде гербария,  подготовлен перечень 32 видов сосудистых растений из Магаданской области, описанных А.П. Хохряковым. Фотографии типовых образцов, а также фотографии некоторых видов в природной обстановке, представлены на сайте ИБПС ДВО РАН http://www.ibpn.ru/kollektsii/261-tipovye-obraztsy-sosudistykh-rastenij

Коллекция семян и плодов насчитывает более 3500 образцов, которые представляют более 2000 видов растений флоры Сибири и Дальнего Востока, имеется электронный каталог коллекции.

Микологический гербарий содержит более 10000 образцов более 760 видов грибов-макромицетов, этикетки занесены в электронный каталог.

Гербарий лишайников включает около 4700 образцов около 270 видов.

Гербарий мохообразных насчитывает более 4400 образцов более 430 видов листостебельных и печеночных мхов. 

Информация о ботанических коллекциях  ежегодно обновляется на сайте ИБПС ДВО РАН (http://www.ibpn.ru/kollektsii, http://www.ibpn.ru/en/collections), а также в Index Herbariorum http://sweetgum.nybg.org/ih/  — The Herbaria of the world. 

В 2016 г. гербарий зарегистрирован как УНУ (уникальная научная установка) «Гербарий (MAG)», ссылка на сайт «Современная исследовательская инфраструктура Российской Федерации»: http://www.ckp-rf.ru/usu/445676/

Электронный гербарий Сибирского федерального университета (KRSU)

Сообщение об ошибке

• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции
  block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247 в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).
• Notice: Trying to get property of non-object в функции block_block_view() (строка 247
  в файле /hosts3/krsu/htdocs/modules/block/block.module).

© Электронный гербарий Сибирского федерального университета

Электронный гербарий МГУ: prokhozhyj — LiveJournal

Прохожий (prokhozhyj) wrote,
2017-01-26 09:54:00 Прохожий
prokhozhyj
2017-01-26 09:54:00

Categories:  

      Гербарий Московского государственного университета (имеющий международный код MW) становится доступен он-лайн. Сканирование гербарных листов началось весной 2015 года, и за полтора года научными сотрудниками и студентами было отсканировано 786 тысяч образцов. Работа продолжается: всего в гербарии МГУ более 1 011 000 листов, собранных от легендарных времён (есть сборы Линнея!) до наших дней, но уже сделанное уже доступно. Найти отсканированные листы можно в Депозитарии живых систем «Ноев Ковчег», вот тут. Выложенные сканы (разумеется, со всеми этикетками) можно увидать в разрешении 300 dpi. Для ботаников это в высшей степени нужно, но вполне может заинтересовать и понадобиться и прочей публике: от школьных учителей до любителей растений. Подробнее про оцифровку гербария MW можно прочитать на «Элементах» (1) или на сайте МГУ (2).
      И про картинку. Я поставил сюда фрагмент листа MW0047448, Calypso bulbosa из бореальных орхидных, сборы 1971 года из Красноярского края. Один лист из 786 000…

 

• Корабельное

  На сайте Минобрнауки стартовало открытое голосовнание по выбору имён для двух строящихся научно-исследовательских судов. НИС традиционно носят…

• Небесное

  И последнее, что мне хотелось выложить вот сейчас из беломорских папок. Совершенно очаровательные когтевидные перистые облака, Cirrus…

• Небесное

  Гало над Избной лудой. Белое море, 6.07, час дня. Кликабельно.

Photo

Hint http://pics.livejournal.com/igrick/pic/000r1edq

Электронный гербарий лекарственных растений родного края

Тема моего исследования «Электронный гербарий в ознакомлении населения с лекарственными растениями родного края».

В течение 4-х лет мы ознакомились с растениями, произрастающими в окрестностях  Мальжагарского 2 наслега. Изготовили более ста гербариев.  Изучали видовой состав лекарственных растений родного края. Нами было исследовано 27 видов лекарственных растений.

В ходе исследования, с целью определения уровня использования и применения лекарственных растений,  мы сделали анкетирование и опрос населения. В результате анализа опроса и анкетирования мы пришли к такому выводу: большинство людей хотели бы заниматься народной медициной, но для этого им нужно знать видовой состав растений, которые произрастают именно в этой окрестности.

Одной фотографии не хватит, для того чтобы распознать эти растения в их естественной среде и мы для этой цели предлагали гербарии, в которых растение представлено в натуральную величину.

С изготовленным нами гербарием мы ознакомили несколько семей. Но каждый раз одалживать гербарий невозможно. Для  того чтобы люди в любой момент могли посмотреть на интересующее их растение мы решили  разработать электронный гербарий.

Цель  исследования   показать эффективный путь ознакомления  населения с  лекарственными растениями родного края.

      Исходя из цели, формулируется гипотеза: эффективным путем  ознакомления населения  с видовым составом лекарственных растений возможно, если использовать электронный гербарий.

Предмет исследования – использование электронного гербария лекарственных растений.

Исходя из цели и гипотезы, были поставлены следующие задачи:

Изучение литературы о лекарственных травах.

Выявить видовое разнообразие лекарственных растений встречающихся в окрестностях родного края

Составить гербарий лекарственных растений данной местности.

На основе полученной информации разработать электронный гербарий лекарственных растений.

Ознакомить население с видами лекарственных растений с помощью электронного гербария.

Гербарий — это научное учреждение, такое же, как библиотека или архив. Только в нем хранятся тщательно собранные, высушенные, научно документированные и этикетированные образцы растений. В настоящее время такие коллекции растений из разных регионов являются единственным источником подлинной информации о биологическом разнообразии земного шара.

Метод гербаризации был изобретен в первой половине XVI в. Итальянским медиком и ботаником Лукасом Гини. Это оказалось весьма кстати, поскольку многочисленные путешествия и экспедиции первооткрывателей были столь продолжительны по времени, что привезти живые растения из дальних неизвестных земель было практически невозможно. Поэтому свои научные коллекции натуралисты-путешественники привозили в виде засушенных растений — гербария.

Электронные копии дают возможность избежать непоправимых потерь редких коллекций в ходе природных катастроф, войн, пожаров и от других неблагоприятных воздействий, что, к сожалению, не раз случалось в истории ботаники. Они также обеспечивают существенную экономию времени и средств, расходуемых на научные командировки, переписку, пересылку образцов.

Для того чтобы разработать электронный гербарий, в первую очередь мы составили якутско-русско-латинский словарь названий лекарственных растений с помощью определителя растений, составили ресурсную характеристику растений.

 Дальше провели проверку наличия необходимых программ на ПК, и техническое обеспечение процесса. У нашего персонального компьютера  —  Windows.  

 Microsoft Power Point 2007 – это программа защиты проекта,  далее в РowerPoint  продумали дизайн основного окна и основных полей. Создали управляющие кнопки и текст, установили гиперссылки.

 Электронный гербарий  готов. В заключении запись на дискету CD-R.

На наш взгляд наш электронный гербарий поможет населению ознакомиться с лекарственными растениями.

Гербарий – Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР)

Гербарий – Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР) skip to Main Content

Genus name	Number of type sheets	Genus name	Number of type sheets	Genus name	Number of type sheets
Aegilops	15	Cydonia	9	Papaver	25
Allium	2	Eriobotrya	1	Prunus	10
Amygdalus	1	Fagopyrum	3	Pyrus	5
Avena	40	Feijoa	1	Raphanus	10
Beta	16	Hordeum	15	Ribes	2
Bistorta	1	Juglans	1	Ricinus	18
Brassica	25	Lathyrus	22	Secale	3
Bromus	2	Linum	1		50
Cannabis	2	Lonicera	1	Sorghum	9
Cerasolouisenia	1	Lotus	2	Spinacia	4
Cicer	22	Lycopersicum	2	Trigonella	1
Citrullus	3	Malus	28	Triticum	54
Citrus	7	Medicago	1	Vicia	2
Cucumis	5	Panicum	10	Zea	8

Back To Top

ГЕРБАРИЙ • Большая российская энциклопедия

• В книжной версии

  Том 6. Москва, 2006, стр. 670-671

• Скопировать библиографическую ссылку:

  ---

Авторы: Р. В. Камелин

ГЕРБА́РИЙ (лат. herbarium, от herba – тра­ва), кол­лек­ция спе­ци­аль­но со­б­ран­ных, рас­прав­лен­ных и за­су­шен­ных в спрес­со­ван­ном ви­де рас­те­ний, а так­же уч­ре­ж­де­ние (или от­дел), где она хра­нит­ся и ве­дёт­ся на­уч. ра­бо­та по сис­те­ма­ти­ке раз­ных групп рас­те­ний или по изу­че­нию рас­тит. ми­ра тех или иных ре­гио­нов Зем­ли. За­су­шен­ные рас­те­ния в Г. снаб­же­ны эти­кет­ка­ми с ука­за­ни­ем да­ты и мес­та сбо­ра, фа­ми­лии и ини­циа­лов сбор­щи­ка, ви­да (по­сле на­уч. об­ра­бот­ки). Счи­та­ет­ся, что спо­соб со­став­ле­ния гер­бар­ных об­раз­цов (гер­ба­ри­за­ция) пред­ло­жен в эпо­ху Воз­ро­ж­де­ния Л. Ги­ни. Ста­рей­шие гер­бар­ные об­раз­цы, хра­ня­щие­ся в не­ко­то­рых ун-тах Ев­ро­пы, от­но­сят­ся к 16 в., в Рос­сии – к нач. 18 в. Су­ще­ст­ву­ет мно­же­ст­во спо­со­бов сбо­ра, прес­со­ва­ния, суш­ки и хра­не­ния об­раз­цов гер­бар­ных кол­лек­ций (напр., в двой­ных лис­тах бу­ма­ги, увя­зы­вае­мых в пач­ки или за­кре­п­лён­ных на лис­тах плот­ной бу­ма­ги и по­ме­щён­ных в ко­роб­ки ли­бо в спец. шка­фы). Гер­бар­ная кол­лек­ция – осн. до­ку­мен­таль­ный ма­те­ри­ал для мн. экс­пе­рим. ра­бот по бо­та­ни­ке, по­зво­ляю­щий точ­но оп­ре­де­лить объ­ект ис­сле­до­ва­ний (в ци­то­ло­гии, па­ли­но­ло­гии, эм­брио­ло­гии или гео­бо­та­ни­ке). Соз­да­ны на­уч. кол­лек­ции со­су­ди­стых рас­те­ний, мо­хо­об­раз­ных, ли­шай­ни­ков, мно­го­кле­точ­ных во­до­рос­лей, мн. групп гри­бов. Об­щее чис­ло толь­ко за­ре­ги­ст­ри­ро­ван­ных в раз­ных уч­ре­ж­де­ни­ях ми­ра гер­бар­ных кол­лек­ций бо­лее 1000. В них хра­нит­ся не ме­нее 150 млн. об­раз­цов рас­те­ний. Круп­ней­ши­ми гер­бар­ны­ми кол­лек­ция­ми об­ла­да­ют: Му­зей ес­теств. ис­то­рии (Па­риж) – ок. 7 млн. об­раз­цов; Ко­ро­лев­ские бо­та­нич. са­ды в Кью (Лон­дон) – ок. 6,5 млн.; Бо­та­нич. ин-т име­ни В. Л. Ко­ма­ро­ва РАН (С.-Пе­тер­бург) – ок. 6,5 млн.; Нью-Йорк­ский бо­та­нич. сад – ок. 6 млн. об­раз­цов. Ок. 20 Г. в раз­ных стра­нах Ев­ро­пы, США, в Ки­тае, Ин­дии име­ют в сво­их фон­дах от 5 до 1,5 млн. об­раз­цов. По ко­ли­че­ст­ву хра­ня­щих­ся гер­бар­ных кол­лек­ций вы­де­ля­ют­ся США (30 млн. гер­бар­ных об­раз­цов). Од­на­ко цен­ность кол­лек­ций оп­ре­де­ля­ет­ся не столь­ко об­щим чис­лом об­раз­цов, сколь­ко чис­лом ти­по­вых об­раз­цов – гер­бар­ных лис­тов, по ко­то­рым бы­ли впер­вые опи­са­ны те или иные ви­ды рас­те­ний. Осо­бен­но цен­ны­ми в этом от­но­ше­нии кол­лек­ция­ми об­ла­да­ет Ве­ли­ко­бри­та­ния (Г. Лин­не­ев­ско­го об-ва в Лон­до­не, в ко­то­ром на­хо­дит­ся лич­ный гер­ба­рий К. Лин­нея, от тру­дов ко­то­ро­го бо­та­ни­ки ве­дут от­счёт пра­виль­ных на­уч. наз­ва­ний рас­те­ний). Мно­же­ст­вом ти­по­вых об­раз­цов сла­вят­ся так­же Г. не­ко­то­рых уни­вер­си­те­тов и н.-и. био­ло­гич. ин­сти­ту­тов Па­ри­жа, Бер­ли­на, Же­не­вы, Ве­ны, Лей­де­на, Сток­голь­ма. В их чис­ле Г. Бо­та­нич. ин-та име­ни В. Л. Ко­ма­ро­ва, МГУ, С.-Пе­терб., Ка­зан­ско­го и Том­ско­го гос. ун-тов. Об­щее же чис­ло гер­бар­ных об­раз­цов в Г. Рос­сии от­но­си­тель­но не­ве­ли­ко (немного бо­лее 10 млн.). Осо­бен­но пол­но пред­став­ле­ны в рос. кол­лек­ци­ях рас­те­ния Ев­ра­зии. Г. ми­ра ве­дут ме­ж­ду со­бой ор­га­ни­зо­ван­ный (бес­плат­ный) об­мен ма­те­риа­ла­ми. Ве­дут­ся ра­бо­ты по соз­да­нию «вир­ту­аль­но­го гер­бар­но­го фон­да» в фор­ме циф­ро­вых изо­бра­же­ний как гер­бар­ных об­раз­цов (пре­ж­де все­го ти­по­вых), так и де­та­лей строе­ния ор­ганов, важ­ных для оп­ре­де­ле­ния ви­дов рас­те­ний.

Королевский ботанический сад Эдинбурга — каталог гербариев

Поиск в каталоге гербариев RBGE

в настоящее время 34% всей коллекции гербария основано на данных. Искать в каталоге британских гербариев RBGE

Введите сведения об образцах, которые вы пытаетесь найти, в соответствующие поля и нажмите «Искать в каталоге».

• Записи могут быть как в верхнем, так и в нижнем регистре.
• ‘*’ может использоваться как подстановочный знак в начале, конце или внутри любого из значений поиска.
  Например, для поиска всех родов, начинающихся с «Гент», введите гент * в поле «Род».
• Несколько критериев поиска в одном поле следует разделять словом «или».
  Например, чтобы найти и горечавку, и рододендрон, введите горечавка или рододендрон в поле Род.

Поиск по коллекционеру

При поиске записей на основе имени сборщика или экспедиции основная база данных использует «произвольный текстовый индекс», что приводит к несколько иному поведению по сравнению с другими полями.Произвольный текстовый указатель разбивает оба индексированные значения и любые условия поиска объединяются с ним в отдельные слова, а затем выполняет поиск поля сборщиков следующим образом:

• Поисковый запрос из одного слова с подстановочными знаками или без них будет вести себя как обычно.
• Будет произведен точный поиск нескольких условий запроса без подстановочных знаков, и результаты будут объединены. например. Поиск Чарльза Дарвина вернет все записи, в которых поле сборщика содержит слова Чарльз и Дарвин.
• Множественные термины запроса с подстановочными знаками будут искать индивидуально, а результаты для терминов с подстановочными знаками будут сочетаться с результатами из терминов без подстановочных знаков. например. Поиск Darwin C * вернет все записи, которые содержат слово Darwin ИЛИ, которые содержат слово, начинающееся с C. Это, вероятно, противоречит интуиции и, скорее всего, сгенерирует более широкий набор результатов, чем ожидалось.
• Более интуитивное поведение в отношении терминов со смешанными подстановочными знаками и без подстановочных знаков в запросе сборщика может быть получено путем включения указания желаемой логической связи между терминами в запросе как части термина запроса.
например. Поисковый запрос «Дарвин и C *» (кавычки не включены в термин) вернет все записи со строкой сборщика, содержащей слово Дарвин И слово, начинающееся с C.

N.B. Поиск по индексу коллектора нечувствителен к порядку. т.е. Поиск Чарльза Дарвина и поиск Дарвина Чарльза вернут один и тот же результат.

Соответствие Нагойского протокола

Обратите внимание, что с 12 октября 2014 года для растительного материала, запрашиваемого у RBGE, может потребоваться предварительное обоснованное согласие страны происхождения.Любые разрешения и условия использования будут сообщены перед выпуском, и если будут какие-либо ограничения, они не будут доступны.

Виртуальный гербарий Австралии

Виртуальный гербарий Австралии

http://www.chah.gov.au/avh/index.jsp

Что такое виртуальный гербарий Австралии?

Виртуальный гербарий Австралии (AVH) — ботанический информационный он-лайн ресурс. доступно через Интернет.Он обеспечивает немедленный доступ к огромному количеству связанных данных с научными образцами растений в каждом австралийском гербарии. Шесть миллионов экземпляров записи, имеющие особое значение для отображения географического распределения, будут улучшены изображениями, описательным текстом и средствами идентификации.

AVH — это совместный проект государства, Содружества и территории гербарии. Он разрабатывается под эгидой Совета глав Австралийские гербарии (CHAH), представляющие основные австралийские коллекции.

Австралийский гербарный дом более шести миллионов экземпляров, которые относятся к самым ранним дням европейских исследований и являются основным источником информации о классификации и распространении растения, водоросли и грибы. Эти образцы — рабочий инструмент ученых. которые вносят свой вклад в наши знания и понимание биоразнообразия и сохранения через открытие, классификацию и описание новых видов.

Каждый образец, хранящийся в австралийском гербарии, сопровождается информацией о том, где и когда он был собран, кем, его правильное ботаническое название и часто информация о связанных видах и экологических предпочтениях. Это, казалось бы, простая информация имеет большую силу, когда она организована в единую распределенную система баз данных, такая как AVH.

Наши гербарии хранят исторический рекорд изменений за более чем двести лет. нашей растительности — беспрецедентные данные для природоохранных и восстановительных работ, и постоянный сборник справочных материалов для отслеживания изменений в названиях растений.это единственная информационная система о растениях, основанная на научно подтвержденном ваучере образцы, поддерживаемые гербариями, чтобы гарантировать актуальность имен как знаний улучшается.

С середины 1970-х годов австралийские гербарии совместно оцифровывают их данные о растениях, водорослях и грибах. «HISPID», набор обмена данными образцов. стандарты, разработанные австралийскими гербариями, в настоящее время приняты во всем мире.

Как работает AVH

Доступ к AVH можно получить через веб-сайт любого участвующего гербария.Шлюз в каждом из этих гербариев связан с базами данных всех других гербарии, объединяя объединенные данные в общенациональное представление о ботанических Информация. Большинство данных, относящихся к образцам, будет храниться ответственным за хранение. учреждение, и будут некоторые ресурсы, такие как научные названия база данных (Австралийский индекс названий растений, APNI), которая будет общей для всех.

С веб-сайта каждого участвующего гербария пользователи также смогут получить доступ к региональной ботанической информации и продуктам электронной флоры, произведенным на местном уровне.

Расширение знаний об австралийских заводах

Биоразнообразие Австралии все еще находится в стадии открытия. Научные названия растений, водорослей и грибов продолжают изменяться с новыми открытиями, и по мере того, как знания нашего вида продолжает расти. Это все еще происходит, даже в лучшем случае известные группы растений и менее удаленные районы. Виртуальный гербарий Австралии будет выделить пробелы в наших знаниях о флоре этой страны.

Ресурсы австралийских гербариев

Гербарии — это научно-исследовательские и информационные учреждения, развивающие ботанические знания. и предоставление информации, подкрепленной сохраненными коллекциями.

Более 70% образцов, хранящихся в гербариях Австралии, зарегистрированы в базе данных, предоставляя исчерпывающий ресурс для:

• Точное отображение географического распространения и встречаемости растений, водоросли и грибы.
• Историческое картирование всех видов растений, водорослей и грибов — информация ценно для понимания угрожающих процессов вырубки растительности и нашествие сорняков.
• Пересмотр классификации каждого растения, группы водорослей и грибов, чтобы дать точное изображение нашего биоразнообразия.

Точные описания более 60% видов сосудистых растений Австралии были составлены за последние 20 лет, многие из них уже доступны в электронном виде. а остальное можно легко сканировать.

Каждый гербарий ведет авторитетную перепись растений для своего региона в электронная форма.

Доступен постоянно растущий ресурс изображений (штриховые рисунки, цветные фотографии), и лишь небольшая часть в настоящее время находится в цифровой форме.

Компьютерные инструменты были разработаны для интерактивной идентификации некоторых региональные флоры или семейства австралийских растений, родов и видов для CD-ROM или в Интернете.

Долгосрочный кооперативный проект

Видение Виртуального гербария Австралии — долгосрочное, требующее приверженности поиску данных и обеспечению широкого доступа к информации.Хотя некоторые аспекты проекта, такие как сбор данных существующих образцов можно измерять годами, сам Виртуальный гербарий существует.

Гербарии правительства Австралии особенно подходят для решения этой проблемы. проект, активно поддерживающий свои коллекции на протяжении многих десятилетий. Они имеют долгую историю сотрудничества для достижения общей цели развития знаний растений, водорослей и грибов этого огромного континента.Все чаще Теперь австралийцы осознают огромную важность экологически устойчивого развития. развитие и разумное использование наших природных ресурсов.

Создание электронной австралийской Flora

Гибкие возможности онлайн-поиска позволяют настраивать генерируемые данные в соответствии с вашими требованиями. Флора Австралии в сети

Австралийские ботаники создали тысячи авторитетных публикации о растениях, водорослях и грибах, включая научные статьи и флору и другие полу-популярные справочники, основанные на сотрудничестве и обширных ресурсах австралийских гербариев.

Флора Австралии и Грибы Австралии , опубликованные австралийским Исследование биологических ресурсов в сотрудничестве с австралийскими гербариями и ботаниками, являются ключевыми проектами в давних традициях австралийских исследований по классификации растений. Эти всемирно признанные публикации поддерживаются сборником данные, информационные материалы, такие как региональные флоры и электронные флоры, хранящиеся в Австралийские гербарии.

Простота хранения данных и информации на компьютере и во всемирной паутине, может обеспечить сложный удаленный доступ к этим данным. Идеально подходит для распространения этих важных знаний на более широкую клиентскую базу.

Виртуальный гербарий Австралии предоставляет возможность доставлять описания флоры, динамически связанные с данными и информацией со всего континента и распространяется в Интернете в виде электронных австралийских Флора — универсальный источник актуальной информации о растениях, водорослях и грибах. всего австралийского континента.Новые наблюдения могут быть выпущены с минимальными затратами. задержка по мере их подтверждения и занесения в базу данных.

Некоторые основные группы заинтересованных сторон AVH

• Агентства по охране природы штата и Содружества
• Агентства природных ресурсов, сельского и лесного хозяйства
• Университеты и школы
• Фермеры и пастбища
• Австралийские и заморские гербарии
• Сети биоразнообразия, e.г. Сеть сообщества по биоразнообразию, Австралийская сеть по сохранению растений
• Streamwatch
• Уход за кустарником
• Landcare
• Береговая служба
• Горнодобывающая промышленность
• Научное сообщество
• Природоохранные группы
• Ботанический сад
• Greening Australia
• Садоводческая промышленность
• Корпорации исследований и разработок
• Глобальный экологический фонд
• Международная организация информации о растениях
• Глобальный информационный фонд по биоразнообразию
• Консультанты по экологии
• Индустрия экотуризма
• Домашние садовники
• Втулочные регенераторы

Некоторые преимущества AVH для основных заинтересованных сторон

• Простой и быстрый доступ к заводской информации
• Расположение и картографирование редких и находящихся под угрозой исчезновения видов
• Правильное наименование растений для науки, охраны природы, медицины, сельского хозяйства и садоводство
• Историческая и исходная информация для проектов восстановления растительности
• Вдохновение и удовольствие от местной растительности Австралии
• Биологическая информация для сбора семян и управления фауной
• Раннее обнаружение видов сорняков
• Лучшее понимание нашего природного наследия
• Биоразведка и коммерческое использование местной флоры, кормов для кустарников и натуральные лекарства
• Выбор подходящих заповедников
• Приоритизация ресурсов для сбора и исследований биоразнообразия
• Информированное экологическое планирование
• Историческая справка и наследие

Пространственное применение данных AVH и стратификация окружающей среды для выборки населения. Австралийский национальный гербарий Исследование бассейна Мюррей-Дарлинг.

Будущее AVH

Партнеры проекта наметили рабочий план и разработку для реализация АВХ, в том числе:

• Завершение сбора данных и проверка 6 миллионов образцов в Австралийские гербарии к 2007 г., включающие протоколы качества данных и геокодированные данные о местоположении точки.
• Расширенные возможности пространственного запроса и визуализации.
• Комплексная национальная перепись нынешних и исторических названий австралийских растений — Австралийская перепись растений .
• Включение улучшений, таких как изображения, описания и идентификация инструменты.
• Разработка механизмов интерпретации данных пространственного распределения через стратегическое партнерство, используемое, например, при принятии экологических решений.
• Расширенные и устойчивые связи, вклад и участие с GBIF и ABIF.
• Обязательство каждого участвующего гербария поддерживать и улучшать свою базу данных и сопутствующие продукты после начальной фазы создания базы данных.
• Дальнейшее развитие межведомственного сотрудничества по гербариям, распространяющееся на Австралазию.
• Повышение признания и осведомленности общественности о ценности гербария коллекции и приложения данных, доступных через AVH.
  

Приложение, позволяющее детям создавать гербарные листы

Digital Herbarium — оригинальное и креативное мобильное приложение для нового поколения гербариев.Весело и познавательно, позволяет создавать и настраивать листы гербария при изучении ботаники

Источник: описание Android (переведено и изменено) / Изображение: Lekalito CC BY-SA 4.0

Полезная информация

Скачать: Android 3.0 (10,62 МБ) / iOS (ссылка отключена)

Цена: бесплатно

Язык: Французский / Испанский / Английский

Работает в автономном режиме: да

Последнее обновление: Android 12.04.2014 (v.1.2) — iOS (ссылка отключена)

Сайт разработчика: Klorane Botanical Foundation

Описание

Это приложение, доступное для устройств Android и iOS (на момент написания этой статьи ссылка на загрузку приложения для iOS выдает ошибку), позволяет детям в возрасте от 6 до 12 лет (возраст, рекомендованный Ботаническим фондом Клорана) создавать гербарные листы судя по фотографиям , которые они получают с помощью мобильного устройства, они могут персонализировать их и присвоить им имена перед сохранением.

Работа приложения очень проста:

• После установки приложение попросит вас сделать снимок на белом фоне листа или ветки, которые вы хотите инвентаризировать. Вы также можете выбрать изображение, которое есть на вашем мобильном устройстве.
• Следующим шагом после проверки изображения является его обрезка. Для этого в приложении есть инструмент под названием «волшебная палочка», который позволяет легко выбрать фон и удалить его. В правом нижнем углу вы увидите ползунок, который при выборе палочки позволяет вам регулировать чувствительность выделения (если вы когда-либо использовали инструмент «волшебная палочка» в Photoshop, вы увидите, что он очень похож), а когда ластик активен, позволяет определить размер кисти для более точного удаления фона.
• Следующим шагом является Studio , раздел, в котором вы можете настроить свое изображение, применяя фильтры, добавляя фон или различные типы значков (чтобы удалить их, перетащите их на нижнюю панель), а также рамку или текст. в котором вы можете указать вид, где вы его собрали и т. д. Стрелки, показанные вверху, позволяют отменять и повторять различные действия.
• После завершения редактирования изображение регистрируется в системе, и его можно использовать в различных социальных сетях.

В приложении также есть боковое меню, которое включает, помимо аспектов, связанных с условиями использования, советы и предостережения о том, как собирать растения, помня, что некоторые виды растений находятся под защитой, а другие могут быть токсичными.

Дополнительная информация

Цифровой гербарий

Video appli herbier digital silent ça pousse Institut Klorane (5 мин. 28 сек. На французском языке)

Изображения: скриншоты 20.02.2017. © Ботанический фонд Клорана

Рейтинг

Анализ

Согласно определению, данному Википедией, гербарий — это «собрание сохраненных образцов растений и связанных с ними данных, используемых для научных исследований», которые «могут быть целыми растениями или частями растений; они обычно находятся в высушенном виде, закрепленном на листе бумаги, но, в зависимости от материала, могут также храниться в коробках или храниться в спирте или другом консерванте ».Его создание требует времени и усилий, поскольку процедура включает в себя множество этапов, таких как сбор различных видов, их сушка, закрепление на листах гербария или консервация.

Хотя традиционное создание гербария может быть увлекательным занятием для детей школьного возраста, желательно также принять во внимание другие более простые альтернативы, в которых требуется меньше инфраструктуры и физических хранилищ. Таким образом, такие приложения, как Цифровой гербарий, могут быть полезным ресурсом для детей, чтобы войти в мир ботаники, поскольку они объединяют аспекты, связанные с социальными сетями или настройкой изображений, с обучением и способностью идентифицировать различные виды, хотя для Для развития этого последнего навыка необходима консультация со специалистами или использование других библиографических или технологических ресурсов (у ботанического фонда Клорана есть еще одно приложение для идентификации растений, называемое IK-Botanic).Различные созданные изображения хранятся в самом мобильном устройстве и могут быть удалены из галереи. В целях возможных улучшений было бы интересно включить инструменты для редактирования уже сохраненных растений, например, для исправления названий видов.

(Посещали 1061 раз, сегодня посещали 1 раз)

Юдит Уркихо

Técnico de medio ambiente, менеджер сообщества и куратор контента especializada en temas de medioambiente — техник по окружающей среде, менеджер сообщества и куратор контента, специализирующийся на вопросах окружающей среды

Компьютеры, базы данных и Интернет

Компьютеры и Интернет ответственны за смену парадигмы в том, как мы работаем в области систематики растений. Компьютеры Выбирайте операционные системы в зависимости от поставленной задачи. Скорее всего, вам потребуется знать несколько систем. Узнайте больше об используемых вами операционных системах. Как компьютеры используются в гербарии? Формы писем Коллекционные базы данных (образцы и библиотеки) Управление инкассо (записи о ссуде, обмене и присоединении) Обмен и визуализация данных о биоразнообразии Работа с общественностью Стандарты баз данных Программы баз данных В чем разница между электронной таблицей и программой разработки базы данных? Развивайте свободное владение НЕСКОЛЬКИМИ приложениями баз данных.Не вводите данные, не зная, как их получить. Не используйте Microsoft Word или другие текстовые редакторы для подготовки этикеток и хранения структурированных данных. MS-Excel (Windows, Mac) — программа для работы с электронными таблицами, которая очень проста и проста в использовании. Это полезно для простой обработки данных. Это отличный инструмент для импорта / экспорта. MS-Access (Windows, Mac) — довольно простая в освоении программа, в которой вы можете разрабатывать надежные базы данных. MS-Foxpro (Windows) — малоизвестная программа, которая на самом деле широко используется многими корпорациями для создания надежных и быстрых баз данных. MS-SQL Server (Windows) — сервер базы данных корпоративного уровня, использование которого может стать дорогостоящим. MySQL (Windows, Mac, Linux) — бесплатная программа для баз данных с открытым исходным кодом. PostgreSQL (Windows, Mac, Linux) — бесплатная программа для баз данных с открытым исходным кодом. OpenOffice (Windows, Mac, Linux) — программное обеспечение с открытым исходным кодом для обработки текстов, электронных таблиц и разработки баз данных. Приложения базы данных для гербарных коллекций Биота 2: менеджер базы данных биоразнообразия Брамс: система ботанических исследований и управления — широко используется, особенно в Европе, Африке и Латинской Америке, для каталогизации гербариев. KE EMu — электронная система управления музеями, предлагающая решения для: музеев, художественных галерей, исторических обществ, гербариев и ботанических садов. Используется многими крупными учреждениями (Ботанический сад Нью-Йорка, Полевой музей, Йельский университет). Довольно дорого! Укажите: «Проект программного обеспечения Specify поддерживает биологические коллекции с помощью программного обеспечения для управления данными, служб преобразования данных, службы поддержки и обучения». Разработка поддержана NSF и используется сотнями музеев. Языки и фреймворки программирования (сценариев) HTML, язык разметки гипертекста, — основной язык программирования в Интернете. Java JavaScript Active Server Pages (ASP) — язык сценариев на стороне сервера, разработанный Microsoft для веб-страниц. PHP — «язык сценариев общего назначения, который особенно подходит для веб-разработки и может быть встроен в HTML». PERL — язык программирования высокого уровня, широко используемый на веб-сайтах для подключения к базам данных и поиска в них. Ruby — «язык программирования с открытым исходным кодом, ориентированный на простоту и производительность». Ruby on Rails — веб-фреймворк с открытым исходным кодом. Специализированные приложения Толкин — Древо жизни Знание и информационная сеть. «Информационное и аналитическое веб-приложение для обеспечения информационной поддержки исследовательских проектов в области фиторазнообразия и биоразнообразия. В качестве веб-приложения TOLKIN может поддерживать совместные проекты, обеспечивая совместный доступ к различным данным о ваучерных образцах, таксономии, библиографии и т. Д. морфология, образцы ДНК и последовательности.« Lucid — интерактивное ключевое программное обеспечение … «гибкий и мощный инструмент управления знаниями, который помогает пользователям проводить идентификацию или диагностику». Программы молекулярных данных …. PAUP Сбор данных и визуализация Веб-сайты

Восстановление поврежденных листьев гербария с использованием методов глубокого обучения для повышения точности классификации

Основные моменты

•

Методы глубокого обучения могут успешно реконструировать изображения поврежденных листьев гербарных образцов.

•

Идентификация растений улучшается с использованием данных реконструированных листьев.

•

Архитектура для конкретных задач и общего назначения полезна для восстановления образцов поврежденных листьев.

•

Доступен новый набор данных по отдельным гербарным листьям для обучения / тестирования различных методов машинного обучения.

Abstract

Лист — один из наиболее часто используемых органов для определения видов.Традиционный процесс идентификации включает в себя ручной анализ ботаниками свойств отдельных сушеных или свежих листьев. Последние достижения в области компьютерного зрения помогли автоматизировать процесс идентификации семейств / видов растений на основе цифровых изображений листьев. Однако большинство существующих исследований сосредоточено на использовании наборов данных для свежих и неповрежденных листьев. Огромный объем данных о консервированных растениях в виде оцифрованных образцов гербариев не был эффективно использован для задачи автоматической идентификации из-за наличия поврежденных листьев в образцах.В этом исследовании методы глубокого обучения были предложены в качестве инструмента для реконструкции поврежденных листьев гербария, чтобы максимизировать полезность оцифрованных образцов для задачи автоматической идентификации растений за счет увеличения количества отдельных образцов листьев. Результаты реконструкции двух разных семейств сверточных нейронных сетей (CNN) были сравнены для данных из десяти различных семейств растений, а именно Anacardiaceae, Annonaceae, Dipterocarpaceae, Ebenaceae, Euphorbiaceae, Malvaceae, Phyllanthaceae, Polygalaceae, Rubiaceae и Sapotaceae.Производительность задачи автоматической идентификации была улучшена более чем на 20% с использованием реконструированных изображений листьев по сравнению с использованием исходных данных (то есть изображений образцов с поврежденными листьями). Эта работа, очевидно, предполагает, что методы глубокого обучения могут быть использованы для реконструкции поврежденных листьев даже на сложном наборе данных о листьях гербария.

Ключевые слова

Глубокое обучение

Поврежденные листья

Генеративные состязательные сети

Частичная свертка

Идентификация видов растений

Гербарии

Рекомендуемые статьи Цитирующие статьи (0)

Просмотреть аннотацию

© 2021 Elsevier B.V. Все права защищены.

Рекомендуемые статьи

Ссылки на статьи

Виртуальный гербарий

Indian Virtual Herbarium — это база данных сушеных растений, которая максимально увеличивает полезность коллекций. Помимо сканированных изображений гербарных образцов, данные на этикетке для каждого вида включают всю информацию о гербарном образце, такую ​​как семейство, род, вид, цитирование автора, подвид, сорт (если есть), сборщик, номер коллекции, дата сбора. , регион гербария, населенные пункты, описание растений, среда обитания и комментарии (если есть) доступны.

JPEG изображение Типа и образец гербария в целом с высоким разрешением, а также цветовая шкала на одной стороне образца, что поможет пользователям идентифицировать виды растений. Пользователи могут просматривать виды по номеру штрих-кода, семейству, роду, коллекционеру и стране. Веб-сайт предоставляет базовые и расширенные возможности поиска. Текст, введенный в базовом поиске, ищется во всех полях базы данных гербария, в то время как расширенный поиск позволяет искать текст в определенном поле. Предоставляется ссылка на IPNI, по которой можно увидеть детали публикации, базионимы и принятые имена.Форма обратной связи позволяет пользователям сообщать об исправлениях и вносить любые предложения.

Сегодня информация о ботанических коллекциях стала более доступной за счет оцифровки, разработки баз данных и Интернета. Цифровые изображения гербарных образцов и электронные записи данных, содержащихся на этикетках образцов, никогда не могут заменить физический гербарий. Однако это единственный способ сделать большие объемы данных, касающихся местных и натурализованных растений Индии, легкодоступными и обеспечит более быстрый доступ к образцам для исследователей во всем мире.Это также обеспечит безопасность коллекции, предоставив цифровую резервную копию физических образцов и сократит транспортировку и транспортировку.

Мы предоставляем цифровые изображения гербарных образцов через [email protected] Форма декларации об авторских правах на гербарные изображения.

Консорциум гербариев северо-запада Тихого океана

Гербарные образцы с северо-запада Тихого океана

3,096,083 записей об образцах и 1,469,016 изображений из 42 гербариев.

Искать в базе данных:

О нас

Консорциум тихоокеанских северо-западных гербариев был создан в 2007 году, чтобы объединить региональные гербарии и предоставить онлайн-портал для огромного количества существующей и новой информации о флоре тихоокеанского северо-запада Северной Америки. Более 3,6 миллионов записей об образцах и многочисленные электронные ресурсы онлайн находятся в ведении 60 гербариев региона, представляющих собой незаменимое хранилище информации для исследований и просвещения населения.Подробнее …

Ищите гербарные образцы по данным на этикетках или по географическому положению. Результаты показывают полные данные этикеток, изображения листов с образцами и карту распределения. Результаты также могут быть загружены или переработаны в контрольный список видов. Загрузите текстовые файлы, содержащие данные этикеток для всех записей об образцах в базе данных Консорциума или для отдельных гербариев. Посмотрите, какие гербарии предоставляют данные об образцах для CPNWH и сколько записей они предоставляют.Метаданные доступны для многих из предоставленных наборов данных.

Создайте списки видов для любых округов Вашингтона, Орегона, Айдахо или Монтаны. Списки могут включать сосудистые растения, мохообразные, лишайники, водоросли и / или грибы. Просмотр или загрузка предварительно упакованных наборов данных, предназначенных для использования на мобильных устройствах без подключения к Интернету. Добавить комментарий Отменить ответ Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены * Комментарий * Имя * Email * Сайт